在内蒙古自治区全面落实“十一五”规划，加快民族文化大区和经济大区建设，构建和谐社会，喜迎北京奥运会的新时期、新阶段举办的一届综合性运动会。本届运动会通过申办在内蒙古通辽市举行。2006年9月9日至13日，内蒙古自治区第十一届运动会在通辽市科尔沁体育馆举行。全自治区的9市3盟参加了本届运动会。
本届运动会从5月开始比赛以来，全区12个盟市代表团的5000名运动健儿参加了32个甲类项目和14个乙类项目的角逐，有110名运动员打破了110项自治区纪录，产生金牌596.5枚，是自治区历史上规模最大、项目最多、参与人数最多的一次体育盛会。此次运动会首次举行了火炬传递、采用了指纹注册和识别及允许民办俱乐部运动员参加比赛。